| Univerzita Komenského v Bratislave - Farmaceutická fakulta | 346 | 47,518,137.94 € | Thursday, October 1, 2026 |
| Univerzita Pavla Jozefa Šafárika v Košiciach | 139 | 16,785,445.78 € | Thursday, October 1, 2026 |
| Slovenská technická univerzita v Bratislave | 89 | 14,153,155.27 € | Tuesday, August 1, 2023 |
| Žilinská univerzita v Žiline | 59 | 8,127,255 € | Thursday, October 1, 2026 |
| Univerzita veterinárskeho lekárstva a farmácie v Košiciach | 45 | 6,721,169.72 € | Wednesday, May 6, 2026 |
| Biomedicínske centrum Slovenskej akadémie vied | 30 | 6,254,625 € | Wednesday, July 7, 2021 |
| Centrum experimentálnej medicíny SAV, v. v. i. | 36 | 5,687,705.18 € | Friday, October 17, 2025 |
| Neuroimunologický ústav Slovenskej akadémie vied, v.v.i. | 69 | 5,237,251.9 € | Friday, October 17, 2025 |
| Národné lesnícke centrum | 40 | 4,930,754 € | Monday, July 10, 2023 |
| Ústav materiálového výskumu Slovenskej Akadémie Vied, v.v.i. | 31 | 4,812,271.63 € | Friday, October 17, 2025 |
| Národné poľnohospodárske a potravinárske centrum | 87 | 4,710,075 € | Monday, September 16, 2024 |
| Ústav anorganickej chémie Slovenskej akadémie vied, v. v. i. | 60 | 4,240,638.5 € | Wednesday, May 6, 2026 |
| Ústav experimentálnej fyziky Slovenskej akadémie vied, verejná výskumná inštitúcia | 64 | 4,056,175.72 € | Thursday, October 1, 2026 |
| Univerzita sv. Cyrila a Metoda v Trnave | 21 | 3,641,851.59 € | Thursday, October 1, 2026 |
| Trnavská univerzita so sídlom v Trnave | 23 | 3,270,906.5 € | Thursday, October 23, 2025 |
| Centrum biológie rastlín a biodiverzity SAV, v. v. i. | 49 | 2,995,790 € | Thursday, October 1, 2026 |
| Trenčianska univerzita Alexandra Dubčeka v Trenčíne | 28 | 2,925,496 € | Thursday, October 23, 2025 |
| Archeologický ústav Slovenská akadémia vied | 16 | 2,577,753 € | Thursday, October 23, 2025 |
| Chemický ústav Slovenskej akadémie vied, v. v. i. | 36 | 2,484,667.48 € | Wednesday, May 6, 2026 |
| Univerzita Mateja Bela v Banskej Bystrici | 21 | 2,374,813 € | Thursday, October 23, 2025 |
| Prešovská univerzita v Prešove | 20 | 2,273,267 € | Tuesday, November 11, 2025 |
| Ústav polymérov, Slovenská akadémia vied | 15 | 1,914,024 € | Monday, August 12, 2024 |
| Technická univerzita v Košiciach | 14 | 1,887,504 € | Tuesday, July 18, 2023 |
| Ústav vied o Zemi, Slovenská akadémia vied, v. v. i. | 15 | 1,874,509 € | Thursday, October 1, 2026 |
| Fyzikálny ústav Slovenská akadémia vied | 93 | 1,837,485.5 € | Thursday, July 16, 2015 |
| Ústav etnológie a sociálnej antropológie Slovenskej akadémie vied | 13 | 1,770,956.74 € | Monday, May 5, 2025 |
| Historický ústav Slovenskej akadémia vied v.v.i. | 15 | 1,666,617 € | Thursday, September 18, 2025 |
| Ústav normálnej a patologickej fyziológie, Slovenská akadémia vied | 11 | 1,260,181.5 € | Thursday, October 12, 2017 |
| Astronomický ústav SAV, v. v. i. | 13 | 1,218,005.5 € | Thursday, October 23, 2025 |
| Slovenská poľnohospodárska univerzita v Nitre | 10 | 1,147,236 € | Monday, July 10, 2023 |
| Ústav geotechniky Slovenská akadémia vied,v.v.i. | 31 | 1,077,759.5 € | Friday, October 17, 2025 |
| Ústav pre výskum srdca, Slovenská akadémia vied | 10 | 1,006,842 € | Wednesday, July 13, 2016 |
| Technická univerzita vo Zvolene | 70 | 780,995 € | Wednesday, May 6, 2026 |
| Univerzita Konštantína Filozofa v Nitre | 29 | 745,487 € | Wednesday, May 6, 2026 |
| Centrum výskumu živočíšnej výroby Nitra | 7 | 678,769 € | Tuesday, October 1, 2013 |
| Ústav výskumu sociálnej komunikácie, Slovenská akadémia vied | 4 | 599,123 € | Tuesday, October 8, 2024 |
| Parazitologický ústav Slovenská akadémia vied, v.v.i.,Košice | 4 | 505,766 € | Thursday, October 1, 2026 |
| Ústav merania SAV, v. v. i. | 2 | 468,717 € | Monday, July 11, 2022 |
| Centrum pre využitie pokročilých materiálov Slovenskej akadémie vied, v.v.i. | 2 | 449,420 € | Tuesday, July 9, 2024 |
| Filozofický ústav Slovenskej akadémie vied | 2 | 412,595 € | Friday, October 17, 2025 |
| Ústav hudobnej vedy SAV, v. v. i. | 2 | 319,433 € | Thursday, April 24, 2025 |
| Ekonomická univerzita v Bratislave | 19 | 310,981.5 € | Friday, October 17, 2025 |
| Katolícka univerzita v Ružomberku | 1 | 285,254 € | Thursday, October 23, 2025 |
| Slovenský metrologický ústav | 2 | 258,459 € | Monday, July 11, 2022 |
| Slavistický ústav Jána Stanislava SAV, v.v.i. | 1 | 231,624 € | Friday, October 17, 2025 |
| Sociologický ústav SAV, v.v.i. | 3 | 228,884 € | Friday, October 17, 2025 |
| Slovenská zdravotnícka univerzita, Bratislava | 8 | 223,657 € | Friday, February 20, 2015 |
| Centrum spoločenských a psychologických vied SAV, v.v.i. | 4 | 210,339 € | Thursday, July 7, 2016 |
| Ústav slovenskej literatúry, Slovenská akadémia vied, v. v. i. | 3 | 193,904 € | Monday, April 11, 2022 |
| Ústav hydrológie, Slovenská akadémia vied | 2 | 184,000 € | Wednesday, July 7, 2021 |
