| Ministerstvo vnútra SR (Sekcia ekonomiky) | 7 | 21,206,504.37 € | Tuesday, August 16, 2022 |
| Neuroimunologický ústav Slovenskej akadémie vied, v.v.i. | 19 | 11,302,539.9 € | Tuesday, November 11, 2025 |
| Slovenská poľnohospodárska univerzita v Nitre | 157 | 3,766,682.48 € | Monday, November 18, 2024 |
| Národné poľnohospodárske a potravinárske centrum | 36 | 2,543,031.59 € | Monday, February 23, 2026 |
| Univerzita Komenského v Bratislave - Jesseniova lekárska fakulta v Martine | 266 | 2,322,778.5 € | Wednesday, September 30, 2026 |
| Univerzita sv. Cyrila a Metoda v Trnave | 47 | 1,984,965.64 € | Tuesday, September 15, 2026 |
| Slovenská zdravotnícka univerzita v Bratislave | 53 | 1,530,866.55 € | Tuesday, October 13, 2026 |
| Univerzita Pavla Jozefa Šafárika v Košiciach | 74 | 1,269,700.73 € | Wednesday, April 1, 2026 |
| Biomedicínske centrum Slovenskej akadémie vied, v. v. i. | 68 | 1,127,989.76 € | Monday, June 1, 2026 |
| Regionálny úrad verejného zdravotníctva so sídlom v Banskej Bystrici | 12 | 1,023,131.52 € | Thursday, April 7, 2022 |
| Univerzita veterinárskeho lekárstva a farmácie v Košiciach | 127 | 983,677.46 € | Wednesday, September 23, 2026 |
| Ministerstvo obrany Slovenskej republiky | 54 | 821,978.26 € | Tuesday, October 7, 2025 |
| Regionálny úrad verejného zdravotníctva Poprad | 1 | 297,600 € | Thursday, October 17, 2024 |
| Onkologický ústav sv. Alžbety, s.r.o. | 3 | 245,475.33 € | Thursday, December 20, 2018 |
| Centrum výskumu rastlinnej výroby Piešťany | 5 | 238,790.4 € | Thursday, December 19, 2013 |
| Národný ústav detskej tuberkulózy a respiračných chorôb, n. o. Dolný Smokovec | 6 | 152,209.31 € | Tuesday, December 20, 2022 |
| Úrad pre dohľad nad zdravotnou starostlivosťou | 1 | 139,628.92 € | Monday, January 13, 2014 |
| Saneca Pharmaceuticals a. s. | 2 | 93,894 € | Monday, August 7, 2017 |
| Centrum biológie rastlín a biodiverzity Slovenskej akadémie vied, v. v. i. | 71 | 89,320.06 € | Wednesday, September 16, 2026 |
| Prešovská univerzita v Prešove | 11 | 87,068.9 € | Thursday, June 30, 2022 |
| Technická univerzita vo Zvolene | 6 | 73,971.3 € | Thursday, August 7, 2025 |
| Parazitologický ústav Slovenskej akadémie vied | 14 | 71,831 € | Thursday, November 23, 2017 |
| Nemocnica s poliklinikou Prievidza so sídlom v Bojniciach | 2 | 64,790.4 € | Friday, May 20, 2016 |
| Národná transfúzna služba SR | 2 | 59,976 € | Wednesday, November 13, 2024 |
| Univerzitná nemocnica Bratislava | 2 | 57,465.6 € | Wednesday, October 2, 2024 |
| Centrum experimentálnej medicíny SAV, v. v. i. | 11 | 55,906.32 € | Friday, February 21, 2025 |
| ŠVPÚ Dolný Kubín | 1 | 43,683.3 € | Friday, July 20, 2012 |
| Fyzikálny ústav Slovenská akadémia vied | 5 | 41,786.94 € | Friday, October 17, 2014 |
| Univerzita Konštantína Filozofa v Nitre | 19 | 41,388.98 € | Wednesday, June 19, 2024 |
| MABPRO, a.s., | 1 | 41,023.68 € | Wednesday, December 12, 2018 |
| Výskumný ústav vodného hospodárstva | 10 | 37,803.22 € | Friday, June 18, 2021 |
| Národné lesnícke centrum | 3 | 31,980 € | Thursday, December 11, 2025 |
| Trnavská univerzita so sídlom v Trnave | 5 | 31,029.52 € | Friday, February 14, 2025 |
| Fakultná nemocnica Trenčín | 2 | 26,413.2 € | Thursday, June 1, 2023 |
| Ústav zoológie Slovenskej akadémie vied, verejná výskumná inštitúcia | 21 | 23,488.52 € | Tuesday, November 12, 2024 |
| Ústav experimentálnej fyziky SAV | 13 | 23,140.2 € | Monday, November 5, 2018 |
| Ústredný kontrolný a skúšobný ústav poľnohospodársky v Bratislave | 1 | 22,236 € | Friday, June 21, 2013 |
| Medzinárodné laserové centrum | 1 | 20,941.2 € | Monday, February 2, 2015 |
| Neurobiologický ústav Slovenskej akadémie vied | 13 | 17,719.42 € | Friday, November 3, 2017 |
| Centrum biovied SAV, v.v.i. | 7 | 17,661.69 € | Friday, August 14, 2026 |
| Ústav molekulárnej biológie, Slovenská akadémia vied | 5 | 17,520 € | Tuesday, September 7, 2021 |
| Slovenská technická univerzita v Bratislave | 3 | 16,384.14 € | Tuesday, February 3, 2026 |
| Ústav fyziológie hospodárskych zvierat Slovenskej akadémie vied | 8 | 16,231.36 € | Monday, November 20, 2017 |
| Národná transplantačná organizácia | 2 | 16,045.83 € | Friday, July 10, 2020 |
| Ústav experimentálnej endokrinológie Slovenskej akadémie vied v Bratislave | 2 | 15,642.35 € | Friday, September 11, 2015 |
| Regionálny úrad verejného zdravotníctva Nitra | 1 | 14,087.16 € | Monday, November 30, 2020 |
| Plemenárske služby Slovenskej republiky, štátny podnik | 7 | 13,372.61 € | Thursday, September 4, 2025 |
| Jadrová a vyraďovacia spoločnosť, a.s. | 1 | 13,188 € | Friday, October 18, 2024 |
| Žilinská univerzita v Žiline | 3 | 12,492.58 € | Wednesday, September 23, 2015 |
| Slovenské národné múzeum | 4 | 11,966.3 € | Tuesday, October 27, 2020 |
